В новом уставе Императорской Медико-хирургической академии, утвержденном 18 декабря

Институт был основан в 1990 году (постановление Совета Министров СССР от 12 марта 1990 года). В 2009 году Институту было присвоено имя академика Натальи Петровны Бехтеревой (Постановление Президиума РАН от 10 февраля 2009)

Отделение неврологии ИМЧ РАН (зав. отделением –д.м.н. Л.Н.Прахова) осуществляет медицинскую помощь при широком спектре неврологических заболеваний.

В ИМЧ РАН создан Центр диагностики и лечения рассеянного склероза, включающий в себя амбулаторную службу, радиологическую службу (МРТ, ПЭТ, КТ) и стационар. На базе института осуществляется диагностика и мониторинг терапии больных с рассеянным склерозом из Санкт-Петербурга, Северо-Запада и других регионов РФ. Применение разработанных нами совместно с ведущими зарубежными и отечественными центрами моноклональных и таблетированных препаратов позволяет значительно улучшить качество жизни пациента. Наши приоритетные исследования позволили сформулировать концепцию динамического развития патологического процесса, как в белом, так и сером веществе головного мозга, показали значение диффузных поражений серого вещества.

Заведующий лабораторией нейроиммунологии, руководитель Центра РС ИМЧ РАН,, проф., д.м.н.  И.Д.Столяров – член международных экспертных советов по новым способам лечения рассеянного склероза, член Совета ECTRIMS (Европейский Комитет по лечению и исследованиям рассеянного склероза), вице-президент РОКИРС (Российский комитет исследователей рассеянного склероза).

Кроме этого в ИМЧ РАН создан Центр поведенческой неврологии. Целью научной деятельности центра является исследование психофизиологических и клинических особенностей различных расстройств психического развития и адаптации. Сотрудники  центра занимаются  разработкой новых методов  диагностики и лечения синдрома дефицита внимания с гиперактивностью, нарушений речевого развития, тиков, тревожных расстройств. Проведенные в Центре исследования показали, что у  детей с последствиями специфических расстройств речевого развития  отмечаются нарушения системы когнитивного  контроля. В результате исследований, проведенных в центре,   впервые определена структура клинических проявлений синдрома эмоционального выгорания (СЭВ).   Руководитель центра – проф, д.м.н.Чутко Л.С.